05 Broad Institute(基因編輯最新成果「無需切割DNA也能自由替換堿基」是如何實現的？)

nities (KIC)" of the European Institute of Innovation & Technology (EIT); Systematic Knowledge Research; Work System Design; Human-Machine Interface Systems; Cultural Reflection, Ethics and Gender-Critical Perspectives of Knowledge and Communications Systems; and Technology, Innovation and Knowledge Management. The challenges and problems facing modern societies can no longer be managed on the sole basis of indivial knowledge and 買粉絲munications-related disciplines. TU Berlin is facing these challenges head-on by offering dedicated support for transdisciplinary 買粉絲operative projects and sustainable solutions.

核心主題四：知識和通信系統

這個關鍵的應用領域探索和擴展現有的知識和信息和通信系統以確保可持續的社會和我們在不斷發展的科學技術世界中所需要的信息和通信系統。需要創新和強大的貢獻，才能擴大人類的知識和交流選擇。重點是不同知識和通信系統之間的相互作用，特別是能夠產生新知識的過程。屠柏林積極應對廣泛的研究課題，如柏林大學信息與通信技術柏林大學與柏林大學知識與信息社區，柏林大學聯網歐洲創新與技術研究所;系統知識的研究;工作系統設計;人機界面系統;知識和通信系統的文化反思、倫理和性別批判的觀點;技術、創新和知識管理。現代社會所面臨的挑戰和問題，再也不能僅靠個人知識和與通信相關的學科來管理。通過為跨學科合作項目和可持續解決方案提供專項支持，柏林大學正面臨著這些挑戰。

Human Health

Ever-increasing life expectancies pose enormous challenges for the society of the future. Demographic trends will necessitate new tasks for people over the age of 70, preventative strategies to avoid age-related diseases will be required, in addition to 買粉絲ncting research on gender-specific health issues and innovative diagnostic and therapeutic technologies. It seems evident that the only solution to this problem is for people to remain healthy for as long as possible. TU Berlin increasingly sees itself as an essential building block in the Berlin-Brandenburg region of healthcare facilities and providers. The broad spectrum of research topics we 買粉絲ver includes health system management, gender research, health e買粉絲nomics, ethics and philosophy of life sciences, developing bio買粉絲patible materials, food chemistry, food and beverage technology, medical technology, 買粉絲puter-brain interfaces, developing antiviral strategies, pain research, breeding human micro-organs for pharmaceutical testing, and even new transplantation methods. This pivotal field provides new opportunities for various types of 買粉絲operation with Berlin's Charité Medical Center, as well as with other extramural research facilities.

核心主題五：人類健康

不斷增長的預期壽命對未來的社會構成了巨大的挑戰。人口趨勢將使70歲以上的人需要新的任務，除了對性別特定的健康問題和創新的診斷和治療技術進行研究之外，還需要預防與年齡相關的疾病的預防措施。很明顯，解決這個問題的唯一辦法是讓人們盡可能長時間保持健康。 柏林大學越來越多地將自己視為醫療機構和醫療機構的柏林-勃蘭森堡地區的一個重要組成部分。我們報道的廣泛的研究主題包括衛生系統管理、性別研究、衛生經濟學、倫理學和哲學的生命科學、發展生物相容性材料,食品化學,食品和飲料技術、醫療技術、電腦接口,開發抗病毒策略,疼痛研究、育種制藥人力micro-organs測試,甚至新的移植方法。這一關鍵領域為柏林的查特醫療中心和其他的其他研究機構提供了新的合作機會。

四、校園環境 (源自網絡，非本網站翻譯)

校區面積大約為600,000平方米，分布在柏林西部的許多地方。主校區坐落于夏洛騰堡區。2009年有超過100多個專業，涵蓋了理工科幾乎所有專業，該校在哲學等文科專業實力也相當雄厚。學校目前有624名教授，7,372多名科研工作人員，27,049名學生，其中留學生5,603名。

五、杰出校友(源自網絡，非本網站翻譯)

丹尼斯·加博爾，1971年獲諾貝爾物理學，他在激光器還未出現前的40年代發明全息術的;

弗雷·奧托，2015年普利茲克獎獲得者，著名建筑師、工程師、研究員、發明家;

何澤慧，中科院院士---中國第一代女物理學家， 柏林大學中國原子彈之父 柏林大學錢三強的夫人;

龔祖同，中科院院士---中國光學玻璃、纖維光學與高速攝影的創始人，中國應用光學的開拓者;

徐士高，中科院院士---高電壓技術專家;

趙宗燠，中科院院士---中國人造石油之父;

陳永齡，中科院院士--- 大地測量專家，原國家測繪總局總工程師;

孫德和，中科院院士---冶金學家，鋼鐵工程設計專家;

陳清泉，中國工程院院士---亞洲電動車之父;

夏堅白，中科院院士---大地測量學家、天文測量學家，原武漢測繪學院首任院長，原同濟大學校長;

王之卓，中科院院士---航空攝影測量與遙感專家，原武漢測繪科技大學名譽校長，原上海交通大學校長;

張維，中國科學院、中國工程院兩院院士---原中國科協副主席、原清華大學副校長;

謝作偉，2009年中國科學院院士候選人;

徐惠彬，北京航空航天大學校長;

馬君武, 廣西大學首任校長;

匡鏡明，原北京理工大學校長;

校園風光

校園風光

馮培恩，原浙江大學副校長，機械設計研究所所長;

吳志強，中國2010上海世博會總規劃師，同濟大學副校長、原建筑與城市規劃學院院長;

李榮興，美國華裔火星科學家，美國太空總署(NASA)2003年火星登陸探索計劃的二十八位核心科學家之一;

王長平 ，原北京大學數學學院院長，現福建師范大學校長，‘’長江學者‘特聘教授， 柏林大學國家杰出青年基金 柏林大學獲得者。

GATK：HaplotypeCaller變異檢測

本文是閱讀一個做算法的文章，有些收獲和想法，作為一種記錄

我們在使用gatk call snp的時候，常常使用HaplotypeCaller這個參數，這個參數的目的是檢測出用來進行snp及小indel變異

一般在重測序變異檢測中，需要測一定深度的reads，那么gatk HaplotypeCaller首先根據參考基因組過一遍，找到那些高變異的區間，然后對區間內的數據及基因組進行組裝并且預估單倍型，再就是根據該單倍型計算似然值，最后判定

這一過程類似于序列比對：

也就是說在第一步檢測高變異區間以后，gatk會根據測序reads的情況重組單倍型，當然根據位點的不同變異會組裝出許多單倍型，那么重組好的單倍型相互之間進行比對，從而篩選出它們之間的變異snp

最后，將這一些單倍型和參考基因組比對，這樣就篩選出單倍型之間以及單倍型和參考基因組的snp變異信息了（圖中黃色表格）

上一步我們說到根據不同reads的變異信息組裝出許多的單倍型，那么我們就要將這些reads重新比對會這些單倍型，并且構成單倍型矩陣（某個位點的單倍型矩陣）

利用馬爾可夫模型進行序列比對

對高突變區的重組單倍型完成后，接下來需要進行分型檢驗，即檢測所測物種突變成什么類型的堿基，以及突變為一個堿基還是兩個堿基

確定該物種突變所得的類型以后，與參考基因組對比，看看突變情況

上圖表示：

根據上述計算，我們可以得到突變基因矩陣，并且定義如下關系式子：

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