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Instagram刷粉絲, Ins買粉絲自助下單平台, Ins買贊網站可微信支付寶付款2024-06-19 13:38:44【】3人已围观
简介從基因或者通路水平來進行關聯分析,是建立在SNP水平的的GWAS分析結果基礎上的,在更高的層次進行深入挖掘,以發現更加有用的信息。MAGMA是進行GSA分析的一款工具,其官網如下Isatoolforg
Is a tool for gene analysis and generalized gene-set analysis of GWAS data it can be used to analyze both raw genotype data as well as summary SNP p-values from a previous GWAS or meta-analysis.
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GWAS分析有兩大坑:
坑1:關聯分析的結果是假陽性(有結果,但結果是錯的);
坑2:目標性狀多基因控制,每個基因效應太弱,結果中找不到顯著相關的位點(干脆沒結果)。
應對以上兩大坑,我們可以采取的常見方法包括:
擴大樣本量,提高檢驗功效。
優化表型鑒定的體系。
提高表型鑒定的精度;
采用多維度的方法對表型進行評估,例如代謝組。
充分利用先驗信息。
使用候選基因或已知內參基因的方法,合理減低閾值 。
注意統計模型的控制和優化。
校正群體結構、系統關系、離群樣本的影響;
計算其他因素,例如:性別,作息習慣,年齡等因素的影響。
采用多階段法驗證候選基因。
階段I:使用寬松的閾值獲得獲選候選位點;
階段II~n:在獨立群體進行驗證。
采用gene based/pathway based 關聯分析的方法,提高檢驗功效。
TWAS:《Opportunities and challenges for transcriptomewide association studies》
《Integrative approaches for large-scale transcriptome-wide association studies》
孟德爾隨機化
孟德爾隨機化(Mendelian Randomization,MR)研究設計,遵循“親代等位基因隨機分配給子代”的孟德爾遺傳規律,如果基因型決定表型,基因型通過表型而與疾病發生關聯,因此可以使用基因型作為工具變量來推斷表型與疾病之間的關聯。
SNP is associated with the exposure
SNP is not associated with 買粉絲nfounding variables
SNP only associated with out買粉絲e through the exposure
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