01 外貿COG什么縮寫(什么是COG？)

什么是COG？

COG”是Cluster of Orthologous Groups of proteins（蛋白相鄰類的聚簇）的縮寫。構成每個COG的蛋白都是被假定為來自于一個祖先蛋白，并且因此或者是orthologs或者是paralogs。Orthologs是指來自于不同物種的由垂直家系（物種形成）進化而來的蛋白，并且典型的保留與原始蛋白有相同的功能。Paralogs是那些在一定物種中的來源于基因復制的蛋白，可能會進化出新的與原來有關的功能。請參考文獻獲得更多的信息。什么是COG？

“COG”是Cluster of Orthologous Groups of proteins（蛋白相鄰類的聚簇）的縮寫。構成每個COG的蛋白都是被假定為來自于一個祖先蛋白，并且因此或者是orthologs或者是paralogs。Orthologs是指來自于不同物種的由垂直家系（物種形成）進化而來的蛋白，并且典型的保留與原始蛋白有相同的功能。Paralogs是那些在一定物種中的來源于基因復制的蛋白，可能會進化出新的與原來有關的功能。請參考文獻獲得更多的信息。

COG是如何建立的？

COG是通過把所有完整測序的基因組的編碼蛋白一個一個的互相比較確定的。在考慮來自一個給定基因組的蛋白時，這種比較將給出每個其他基因組的一個最相似的蛋白（因此需要用完整的基因組來定義COG。注1）這些基因的每一個都輪番的被考慮。如果在這些蛋白（或子集）之間一個相互的最佳匹配關系被發現，那么那些相互的最佳匹配將形成一個COG（注2）。這樣，一個COG中的成員將與這個COG中的其他成員比起被比較的基因組中的其他蛋白更相像，盡管如果絕對相似性比較的。最佳匹配原則的使用，沒有了人為選擇的統計切除的限制，這就兼顧了進化慢和進化快的蛋白。然而，還有一個加的限制就是一個COG必須包含來自于3個種系發生上遠的基因組的一個蛋白。

很赞哦!（4475）